GAPLS-Toolkit:基于遗传算法优化的偏最小二乘回归分析工具包
项目介绍
GAPLS-Toolkit 实现了一种创新的混合建模方法,将遗传算法(GA)的全局优化能力与偏最小二乘法(PLS)的强大建模能力相结合。该工具包专为处理高维数据设计,通过自动筛选最具解释力的特征变量,有效解决多重共线性问题,显著提升回归预测模型的精度与鲁棒性。适用于化学计量学、生物信息学、金融建模等领域的复杂数据分析任务。
功能特性
- 智能特征选择:利用遗传算法全局搜索最优变量子集,避免人工选择的主观性。
- 参数自适应优化:集成交叉验证,同步优化PLS模型潜变量数量与输入变量组合。
- 全面模型评估:提供RMSE、R²、Q²等多种指标,全面评估模型预测性能与稳健性。
- 直观可视化分析:生成迭代收敛曲线、变量选择路径等图谱,辅助模型分析与解释。
- 用户友好交互:支持关键参数灵活配置,同时提供自适应选项以满足不同场景需求。
使用方法
- 准备数据:将自变量数据整理为数值矩阵
X(n×p),响应变量整理为向量或矩阵 Y(n×1 或 n×m)。 - 设置参数(可选):根据需要指定遗传算法参数(如种群大小、迭代次数、交叉率、变异率)和PLS成分数范围。若未指定,工具包将使用内置的默认参数。
- 运行主程序:执行主函数,工具包将自动完成数据预处理、GA-PLS混合优化、模型训练与验证全过程。
- 获取结果:工具包输出内容包括:
* 优化后的PLS模型参数(如最佳潜变量数量、回归系数)。
* 遗传算法筛选出的关键变量索引及其重要性排序。
* 模型在训练集与测试集上的预测结果与性能指标(RMSE、R²等)。
* 可视化图表(收敛曲线、变量选择图谱等)。
系统要求
- 操作系统:Windows / Linux / macOS
- 软件环境:MATLAB R2016a 或更高版本
- 必要工具箱:Statistics and Machine Learning Toolbox
文件说明
主程序文件整合了工具包的核心工作流程,承担了从数据加载与预处理、遗传算法种群初始化与迭代优化(包括选择、交叉、变异操作)、偏最小二乘回归模型构建与潜变量提取、基于交叉验证的模型性能评估,到最终结果输出与可视化图谱生成的全部关键功能。