MATLAB高效双聚类分析工具箱
项目介绍
本项目实现了一个功能完备的双聚类算法工具箱,集成了多种经典双聚类算法,包括CC(Cheng-Church)、Bimax、OPSM、ISA、FLOC、XMotif等。该工具箱专门设计用于对基因表达数据、用户-商品评分矩阵等二维数据进行同步行列聚类分析,通过矩阵分解技术、贪婪迭代搜索算法和模式相似度匹配优化等手段,帮助研究人员发现数据中隐藏的局部模式结构。
功能特性
- 多算法支持:集成CC、Bimax、OPSM、ISA、FLOC、XMotif等多种经典双聚类算法
- 灵活数据输入:支持CSV、TXT、MAT等格式文件导入,处理10×10至10000×10000规模的数值型二维矩阵
- 数据兼容性强:支持标准化和非标准化数值数据
- 全面输出功能:提供双聚类结果结构体、质量评估指标(MSR得分、覆盖度等)、交互式热力图可视化
- 结果导出:支持MAT格式和Excel报表导出
使用方法
- 数据准备:准备数值型二维矩阵数据(CSV、TXT或MAT格式)
- 算法选择:根据数据类型和分析需求选择合适的双聚类算法
- 参数设置:配置算法特定参数和质量阈值
- 执行分析:运行双聚类分析流程
- 结果查看:查看双聚类结果、评估指标和可视化图表
- 结果导出:将分析结果导出为所需格式
系统要求
- MATLAB R2018a或更高版本
- 至少4GB内存(处理大型矩阵建议8GB以上)
- 需要安装Statistics and Machine Learning Toolbox
文件说明
main.m文件作为工具箱的主入口程序,承担了数据加载预处理、算法调度执行、结果评估分析和可视化展示等核心功能集成,通过统一的接口管理整个双聚类分析流程,确保用户能够便捷地完成从数据输入到结果输出的完整分析任务。