基于PCA和KPCA的主成分分析与降维算法实现
项目介绍
本项目是一个基于MATLAB开发的特征提取与数据降维工具,实现了经典的主成分分析(PCA)和核主成分分析(KPCA)两种核心算法。该项目专为智能技术、模式识别及机器学习课程设计,旨在通过对比线性与非线性降维技术,处理高维复杂数据集。通过本项目,用户可以观察到传统PCA在处理非线性流形数据时的局限性,以及KPCA如何通过核函数映射有效地还原数据的内在结构。
功能特性
- 自动化数据生成:内置三维螺旋线(Spiral)流形数据生成器,支持自定义样本量并加入高斯随机噪声,模拟真实的复杂数据环境。
- 双算法协同支撑:
- 线性降维:提供主成分分析(PCA),通过协方差矩阵分解提取最大方差方向。
- 非线性降维:提供核主成分分析(KPCA),内置多种核函数以适配不同分布的数据。
- 灵活的核函数库:支持径向基函数(RBF/高斯核)、多项式核(Polynomial)以及线性核(Linear)。
- 完整的数据预处理:包含Z-score标准化处理,确保不同量纲的特征在降维过程中具有相同的权重。
- 结果量化与可视化:实时计算各主成分的方差贡献率,并通过三维到二维的对比图表直观展示降维效果。
系统要求
- 软件环境:MATLAB R2016b 或更高版本。
- 依赖工具箱:基础数学函数库(无需额外工具箱)。
功能逻辑与实现流程
本项目的主程序逻辑严谨,遵循标准的数据科学工作流:
- 数据模拟阶段:
主程序首先生成一个三维空间中的螺旋线数据集。该数据集通过参数方程构建,具有明显的非线性流形特征,能够有效检验降维算法对空间结构的保持能力。数据生成后会叠加0.5倍率的随机噪声以增加挑战性。
- 数据标准化预处理:
在执行降维前,程序调用标准化子函数。通过计算原始数据的均值和标准差,将数据转换为均值为0、方差为1的标准正态分布,消除特征间物理量纲的影响。
- 线性PCA降维实现:
程序计算标准化数据的协方差矩阵,并进行特征值分解。通过对特征值进行降序排列,选择前k个最大的特征值对应的特征向量组成投影矩阵。最后将中心化后的数据投影至该低维子空间,并计算累计方差贡献率。
- 非线性KPCA降维实现:
这是本项目的核心模块,其实现逻辑分为以下关键步骤:
- 核矩阵计算:使用选定的核函数(如RBF)计算样本间的相似度矩阵。
- 核矩阵中心化:由于特征空间中的映射通常不是中心化的,程序执行了中心化变换,通过公式 K = K - 1n*K - K*1n + 1n*K*1n 确保特征空间的均值为零。
- 特征值分解与归一化:对中心化核矩阵进行分解。关键细节在于,程序对提取的特征向量进行了归一化处理(除以特征值的平方根),这是保证投影后数据尺度正确的必要步骤。
- 投影计算:通过核矩阵与归一化特征向量的乘积,得到数据在非线性特征空间中的投影坐标。
- 可视化评估:
程序通过一个多栏画布展示三个维度的图像:原始三维带噪数据流形、PCA降维后的平面分布、KPCA降维后的平面分布。所有图像均采用颜色映射(Colormap)来追踪原始数据的序列关系。
关键实现细节分析
主成分分析算法:
在算法实现中,严格遵循统计学定义。通过计算 (X' * X) / (n - 1) 获取样本协方差,确保了计算的严谨性。
核函数机制:
在计算核矩阵时,针对RBF核采用了高效的矩阵运算技巧(bsxfun),通过展开欧氏距离公式有效避免了双层循环,极大提升了处理大规模样本时的运行效率。
特征向量修正:
KPCA函数中包含对数值误差的处理逻辑。在排序后,程序会自动将由于浮点运算产生的极小负特征值归零,并仅对正特征值对应的向量进行单位化,增强了代码的鲁棒性。
标准化子函数:
独立封装的标准化模块不仅返回处理后的数据,还保留了均值和标准差参数,这符合生产环境下对测试数据进行相同变换的流程逻辑。