基于邻域保持嵌入(NPE)的高维数据降维与可视化系统
项目介绍
本项目实现了邻域保持嵌入(Neighborhood Preserving Embedding, NPE)算法,用于对高维数据进行非线性降维处理。NPE通过构建局部邻域图来保持原始数据的局部几何结构,将高维数据投影到低维空间,同时保留数据之间的邻域关系。该算法适用于数据可视化、特征提取和模式识别等任务。项目包含完整的算法实现、参数优化模块以及可视化展示功能,支持用户自定义邻域大小和降维维度。参考文献基于He et al. 2005的论文《Neighborhood Preserving Embedding》。
功能特性
- 局部邻域图构建:支持k近邻(k-NN)或ε邻域方法构建数据点的局部邻域结构
- 权重矩阵优化:通过最小化局部线性重构误差,计算最优的邻域权重矩阵
- 广义特征值分解:求解投影变换矩阵,实现高维到低维的线性投影
- 参数可配置:支持用户自定义邻域大小(k值)和目标降维维度(d值)
- 可视化展示:提供降维结果的可视化界面,直观展示数据分布和结构保持效果
- 性能评估:输出重构误差指标,量化评估降维过程中局部结构的保持程度
使用方法
输入参数说明
- 数据矩阵(X):m×n的二维数组,其中m为样本数量,n为特征维度
- 邻域参数(k):正整数,指定近邻数量(默认值k=5)
- 目标维度(d):正整数,指定降维后的维度(需满足d < n)
输出结果说明
- 降维数据(Y):m×d的二维数组,表示投影后的低维数据
- 投影矩阵(A):n×d的变换矩阵,可用于新样本的降维转换
- 重构误差(loss):标量值,反映降维过程中局部结构的保持程度
基本使用流程
- 准备高维数据矩阵X
- 设置合适的邻域参数k和目标维度d
- 运行NPE算法进行降维处理
- 获取降维结果Y、投影矩阵A和重构误差loss
- 使用可视化功能展示降维效果
系统要求
- MATLAB R2018a或更高版本
- 支持的操作系统:Windows/Linux/macOS
- 内存要求:至少4GB RAM(具体取决于数据规模)
- 硬盘空间:至少100MB可用空间
文件说明
主程序文件实现了NPE算法的核心流程,包括数据预处理、邻域图构建、权重矩阵计算、特征值分解求解和结果输出等完整功能。该文件整合了参数设置、算法执行和可视化展示模块,提供用户交互界面,支持自定义参数输入和降维效果实时展示,同时包含错误处理和性能评估机制,确保算法稳定运行并输出可靠的降维结果。