本站所有资源均为高质量资源,各种姿势下载。
DNA序列分析是生物信息学中的基础任务之一,通常涉及对碱基(A、T、C、G)组成的字符串进行处理。题目可能要求实现以下典型操作:
序列比对:比较两条DNA序列的相似性,例如计算汉明距离(相同位置不同碱基的数量)。 模式统计:统计特定子串(如"ATG"起始密码子)的出现频率或位置。 反向互补链生成:根据碱基互补规则(A-T、C-G)生成反向序列,这是PCR扩增等操作的模拟。 GC含量计算:计算序列中G和C碱基的占比,可用于分析序列稳定性(GC键更稳定)。
解决思路通常需要将生物学问题转化为字符串操作,可能结合滑动窗口、哈希表等算法优化效率。例如,统计k-mer(长度为k的子串)分布时,可通过预计算减少重复遍历。