基于M-file的偏最小二乘建模与判别分析系统
项目介绍
本项目是一个基于MATLAB M-file语言开发的偏最小二乘(PLS)与偏最小二乘判别分析(PLS-DA)建模系统。系统实现了完整的PLS/PLS-DA算法框架,集成了数据预处理、模型训练、交叉验证和预测等功能。采用留一法交叉验证(LOOCV)进行模型性能评估与参数优化,为化学计量学、生物信息学等领域的多变量数据分析提供了完整的解决方案。
功能特性
- 完整算法实现:包含经典PLS回归和PLS-DA判别分析算法
- 模型验证体系:采用留一法交叉验证进行模型性能评估
- 灵活参数配置:支持潜变量数量、标准化处理、最大迭代次数等参数自定义
- 全面输出结果:提供回归系数、载荷矩阵、权重矩阵等模型参数
- 性能评估指标:输出交叉验证误差、预测准确率、混淆矩阵等验证结果
- 数据可视化:生成得分图、载荷图、误差分析图等多种诊断图表
- 预测功能:支持新样本的连续值预测和分类判别
使用方法
基本调用格式
% PLS回归分析
[model, results] = main(X, Y, 'mode', 'PLS', 'lv', 5);
% PLS-DA判别分析
[model, results] = main(X, Y_labels, 'mode', 'PLS-DA', 'standardize', true);
输入参数说明
- X:m×n维自变量矩阵(m为样本数,n为特征变量数)
- Y:m×p维因变量矩阵(PLS)或m×1维分类标签向量(PLS-DA)
- 可选参数:
-
mode:分析模式('PLS'或'PLS-DA')
-
lv:潜变量数量(默认自动优化)
-
standardize:数据标准化选项(默认true)
-
maxIter:最大迭代次数(默认500)
输出结果
- model:包含回归系数、载荷矩阵、权重矩阵等模型参数
- results:包含交叉验证误差、预测准确率、混淆矩阵等验证结果
- 图形输出:自动生成模型诊断和可视化图表
系统要求
- MATLAB版本:R2016b或更高版本
- 必需工具箱:Statistics and Machine Learning Toolbox
- 内存要求:建议4GB以上,具体取决于数据规模
- 磁盘空间:至少100MB可用空间
文件说明
主程序文件整合了数据预处理、模型训练、交叉验证和结果可视化四大核心模块。它负责协调整个分析流程,包括数据的标准化处理、潜变量因子提取、回归模型构建、留一法交叉验证执行以及预测结果的生成。该文件还实现了模型性能的图形化展示功能,为用户提供直观的分析结果诊断。