基于MATLAB的高效特征选择与数据降维系统
项目介绍
本系统是一个集成了过滤式(Filter)、包裹式(Wrapper)和嵌入式(Embedded)三大主流特征选择框架的MATLAB平台。系统旨在解决高维数据集中的维度灾难问题,通过多种评估准则和搜索策略,帮助用户识别关键特征、降低模型复杂度并提升分类性能。系统不仅实现了多种核心算法,还集成了完整的数据预处理流程和多维度的可视化分析模块。
功能特性
- 多范式算法集成:涵盖了相关系数、ReliefF、拉普拉斯得分、互信息、Lasso、NCA、遗传算法(GA)及粒子群算法(PSO)。
- 全流程数据处理:支持缺失值填充、数据标准化(Z-score)及归一化处理。
- 启发式子集搜索:利用智能优化算法在特征空间中自动化搜索最优特征组合。
- 深度可视化矩阵:提供相关性热图、权重对比图、算法收敛曲线、重合度矩阵及降维空间分布图。
- 自动性能评估:内置基于交叉验证的分类器性能评价机制,生成系统分析报表。
使用方法
- 环境配置:将所有相关的MATLAB函数脚本放置于程序搜索路径中。
- 数据输入:主程序默认生成模拟高维数据(含强相关、弱相关特征及噪声),用户也可在脚本开头载入自定义的特征矩阵X与标签向量y。
- 过程执行:直接运行主脚本,系统将依次执行预处理、特征评估、启发式搜索及结果汇总。
- 结果解读:通过生成的九宫格可视化画布,对比各算法筛选出的Top特征,观察GA/PSO的进化轨迹,并从报表中获取最终的降维压缩比和最佳特征索引。
系统要求
- 软件环境:MATLAB R2020a 或更高版本。
- 依赖工具箱:Statistics and Machine Learning Toolbox(用于执行Lasso、NCA、KNN分类及PCA降维)。
系统实现逻辑说明
系统在内部遵循严谨的数据科学处理流:
- 实验环境模拟:构建一个包含150个样本、50个特征的复杂数据集。其中前4个特征与标签强线性相关,第5至10个特征为弱相关,其余为高斯噪声。系统还人为注入了缺失数据以测试鲁棒性。
- 数据清洁与增强:采用中位数填充(median imputation)处理缺失值,随后同步进行Z-score标准化和0-1缩放,确保算法在数值运算时的稳定性。
- 特征评价引擎:
- 过滤式流程:计算特征与标签的皮尔逊相关系数;运行ReliefF算法通过邻域样本距离调整特征权重;计算拉普拉斯得分以评估特征对局部结构的保持能力;通过离散化计算互信息以捕捉非线性依赖。
- 嵌入式流程:执行Lasso正则化,通过5折交叉验证确定最佳Lambda值,提取非零权重特征;利用邻域成分分析(NCA)进行具有正则化约束的特征学习。
- 包裹式流程:以5折交叉验证下的KNN分类准确率为适应度函数,驱动GA和PSO算法。
- 综合降维:选取评估表现最优的特征子集进行空间映射,并与原始全特征空间的PCA降维效果进行对比。
关键函数与算法细节分析
- 缺失值处理:利用 fillmissing 函数,通过忽略NaN的 median 统计量实现跨维度填充。
- 自定义拉普拉斯得分 (calculate_laplacian_score):通过构建基于RBF核的邻接矩阵,计算拉普拉斯矩阵 L,评估特征 fi 消除中心化后的分式值,分值越小代表特征的局部保持能力越强。
- 互信息计算 (calculate_mutual_info):采用等宽离散化技术将连续特征映射至有限区间,通过计算边缘概率与联合概率的对数比,量化特征对类别的贡献。
- 包裹式评价准则 (eval_fitness):集成 fitcknn 分类器,通过 kfoldLoss 计算泛化误差,并将(1-误差)作为优化算法的适应度目标。
- 遗传算法实现 (genetic_algorithm_fs):实现了包含二进制编码、轮盘赌选择(Roulette Wheel Selection)、单点交叉及基因变异的完整遗传迭代过程。
- 粒子群算法实现 (pso_algorithm_fs):基于Sigmoid映射实现了二进制PSO,通过惯性权重(w)和学习因子(c1, c2)动态更新粒子速度,搜索最优特征掩码。
- 可视化集成:利用 imagesc 展示特征相关性及算法选择的重合度;使用 gscatter 绘制降维后的样本分布;利用 polarplot 绘制雷达图,直观展现多算法子集在分类准确率上的差异。