MATLAB集成双聚类分析工具箱
项目介绍
本工具箱是针对大规模矩阵数据(如基因表达数据、用户-项目评分矩阵等)开发的双聚类分析解决方案。通过整合CC、Bimax、OPSM、ISA、FLOC、xMotif等主流双聚类算法,提供从数据预处理到结果可视化的完整分析流程,帮助用户发现数据中局部有意义的模式结构。
功能特性
- 多算法融合架构:集成6种经典双聚类算法,支持算法并行计算优化
- 完整分析流程:提供数据加载、预处理、算法执行、结果评估和可视化一体化解决方案
- 灵活参数配置:支持通过配置文件自定义算法参数和阈值设置
- 专业评估体系:内置MSR、基因覆盖率等多种双聚类质量评估指标
- 交互式可视化:生成热力图、模式分布图等直观展示分析结果
使用方法
基本使用流程
- 准备输入数据(.mat、.txt或.csv格式的m×n数值矩阵)
- 配置算法参数(可选使用参数配置文件)
- 运行主程序进行双聚类分析
- 查看输出的双聚类结果和评估报告
- 分析可视化结果并导出
数据输入要求
- 主要输入:m×n二维数值矩阵
- 支持标准格式:.mat、.txt、.csv文件
- 可处理包含缺失值的不完整矩阵(需预先处理)
输出结果
- 双聚类集合(包含行列索引信息)
- 质量评估指标(MSR、覆盖率等统计值)
- 可视化图表(热力图、模式分布图)
- 算法性能对比报告
系统要求
- 操作系统:Windows/Linux/macOS
- MATLAB版本:R2016b或更高版本
- 内存建议:4GB以上(处理大规模数据时推荐8GB+)
- 工具箱依赖:Statistics and Machine Learning Toolbox
文件说明
main.m文件作为工具箱的核心入口,实现了数据加载与预处理、多种双聚类算法的集成调用与参数配置、分析结果的质量评估与指标计算、双聚类模式的可视化展示以及不同算法性能的对比分析等主要功能,为用户提供一站式的双聚类分析解决方案。