经典密度聚类(DBSCAN)算法MATLAB实现
项目介绍
本项目提供了一个纯MATLAB编写的DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)聚类算法实现。DBSCAN是一种基于密度的空间聚类算法,它将簇定义为密度相连的点的最大集合,能够识别任意形状的簇并在包含噪声的数据集中表现出色。本项目无需任何额外的MATLAB工具箱,实现了从数据生成、距离计算到核心聚类逻辑及结果可视化的完整流程,方便用户直接运行并理解算法细节。
功能特性
- 纯MATLAB实现:算法核心逻辑完全基于MATLAB基础语法,不依赖于Statistics and Machine Learning Toolbox。
- 自适应形状识别:能够有效识别非线性、环形及复杂形状的几何分布。
- 噪声处理能力:具备完善的噪声点识别机制,能将低密度区域的点标记为离群值。
- 参数直观性:通过邻域半径(Eps)和最小点数(MinPts)两个关键参数控制聚类效果。
- 完整可视化:内置结果绘图功能,通过颜色区分不同簇,并以特殊符号标注噪声。
系统要求
- 软件版本:MATLAB R2016b 或更高版本。
- 硬件要求:通用PC即可,对于本项目示例的330个样本,内存消耗极低。
核心实现逻辑
程序主要分为以下八个阶段:
- 合成数据集生成:
程序首先生成一个包含330个样本的测试集。其中包括两个半径分别为2和5的同心环形分布(各150个点),并叠加了高斯分布的随机扰动。此外,通过随机坐标生成了30个散布在空间中的噪声点,用于验证算法的稳健性。
- 预设参数:
设置邻域半径阈值 Eps 为 0.8,核心点所需的最小邻域点数 MinPts 为 5。
- 状态初始化:
创建一个标签向量,用于记录每个样本的状态。标签定义如下:
- 0 表示尚未处理。
- -1 表示暂时识别为噪声点。
- 正整数表示该点所属的核心簇编号。
- 欧氏距离矩阵计算:
在进入聚类循环前,程序通过双重循环预先计算所有点对之间的欧氏距离,构建对称的距离矩阵。这种做法避免了在聚类过程中重复进行平方根和求和运算,提升了执行效率。
- 密度聚类核心算法:
遍历数据集中的每一个点,若该点未被处理,则查找其在 Eps 半径内的所有邻居:
- 如果邻居数量少于 MinPts,则暂时将其标记为噪声。
- 如果邻居数量满足 MinPts,则创建一个新簇,并以此点为起点,采用种子集(队列)的方式进行密度扩展。
- 区域增长与簇扩展:
对于每一个新发现的核心点,程序会动态地将其邻域内的点加入候选种子集。在扩展过程中:
- 若种子点之前被标记为噪声,则将其重新归类为当前簇的边界点。
- 若种子点尚未被处理,则将其加入当前簇,并递归检查该点是否也满足核心点条件,从而实现簇的不断生长。
- 统计输出:
完成遍历后,程序自动计算发现的簇总数及识别出的噪声点总数,并在控制台打印详细结果。
- 结果呈现:
通过绘图窗口,使用不同的颜色区分各个簇,并使用“x”符号专门标注出噪声点。同时提供图例和包含参数信息的标题。
关键组件分析
- 距离矩阵(dist_matrix):作为算法的底层支撑,它将几何空间关系转化为数值矩阵,使得邻域查询操作简化为矩阵索引。
- setdiff 函数应用:在扩展簇时,利用此函数筛选出邻域中尚未包含在当前种子集中的新点,有效防止了算法陷入无限循环并提高了扩展效率。
- 标签状态机:通过 0、-1 以及正整数的转换,清晰地管理了点的生命周期,确保每个点只被赋予一个最终分类方案。
- 辅助转换工具:内置了简单的数值转字符串工具函数,用于动态生成图例标签,增强了绘图部分的灵活性。
使用方法
- 将项目的源代码文件放置在MATLAB的工作路径下。
- 在命令窗口直接输入主程序名或点击运行按钮。
- 程序将自动生成模拟数据、执行聚类逻辑并弹出可视化结果图。
- 用户可以根据实际业务需求,修改程序中的 Eps 和 MinPts 参数来观察不同密度阈值下的聚类表现。