Analysis of Phylogenetics and Evolution with R.second edition

资 源 简 介

Analysis of Phylogenetics and Evolution with R.second edition

详 情 说 明

《Analysis of Phylogenetics and Evolution with R》（第二版）是一本专注于利用R语言进行系统发育学和进化分析的技术指南。本书为研究人员和生物信息学从业者提供了从基础理论到实际应用的完整工具链，特别强调如何通过R的强大统计和可视化能力处理分子序列数据、构建进化树以及检验进化假设。

书中系统性地介绍了ape、phangorn等关键R包的使用方法，覆盖了距离矩阵计算、最大似然法、贝叶斯推断等主流算法实现。不同于纯理论教材，本书的亮点在于将算法逻辑转化为可操作的R语言实践，例如如何通过代码调整分支长度优化策略，或可视化不同树形结构的支持率差异。

第二版相比前作增加了对高通量测序数据分析的适配内容，反映了当前研究中对基因组尺度数据的处理需求。对于需要处理大规模分子数据的进化生物学研究者，书中整合的并行计算和树形结构压缩技术尤其具有实用价值。